我有一个这样的文件：
VLLKHCGRMRRFLIRNLRSFLSHISLNTLKSQESKV
LLSSQAKMYFSLRENFYLEGGIETTFVPSGEVYSRSFLKGISRI
LNPNALPTSPISENWVMVRPIVAQISLRRMTPSAIGAQTEMA
MKLELLLAFKYLIPKRKRLSSSIVSAFSMGIVALVVWLSVVFMSVIHGLQQRWVGDLASLHSSIRIEPSDKYYESYYYQIDSHAEASQYIYKTIGEKLLCEQTDPYDPDVDFLLPEAFPDPEFSDNGEMIDPVRTANERMLSLFSSRKGSFVEFEEGMGHVHMDRAFRGHKGEPRALSQYIAYSSDILYQQRMLPFEETDYSTEVLNRFNASSEGWLADFLVLQEKFRGMSVILPVVYRDQGYRVGDTASLSVFSVKKEGEVRFPLRVIGFYNPGVSPFGGKTIFIDKELAASIRSESEGLGMHNGWQVFLPSVQDIPVMKQSIQKIFKESEVSSYWEISSLYDYEFFKPILDQLQSDQVLFSIVSFIVLIVACSNIVTMSILLVNNKKKEIGILKAMGVSSSRLQLVFGLCGACSGLVGALLGSILAALTLKNLGILTHWLSKLQGREAFNPSFFGEQLPQDFHLPTVICLSLGALVLAAISGAIPAQHVARMQVSDILKSE
MVILVEAKHISKVIQQQDVCIPILKDVSFQLHAGEVVAITGASGSGKSSLLHLLGTLDQPSSGQILFFGKQVRREELPIFRNCRIGFIFQNFYLLEDDSVINNVLMPAQIARKDTGQKSKARERALALLESVGLVDRRDEKGSLLSGGEKQRVAIARALMNDPEIVLADEPSGNLDHRTADTIHELLLALAEKHRGVLIVTHDRELAEKCHREEILRDGTLMQRQ
LKDTVTPNYHPGMIRRFRPLTQTSTRSGYHKSE
LHVSCLEWLSMITFTRTPLRIAWARAKKNSGLKKIYIKTKILSVAWLIAFKIIFDAALGIKRWIGM
LADPVTTVWKSANIVFLCWRVLPLVRRKTTLEF
LARRRSGSFRGGRRSVFGSLVFSLGSGEHLLGDGY
VGARVRIDANRLSIPSMIVFIANNRRGLWVTIPF
VEEVGSGGLKRSLYFKEEEPCTLITLRSWLEKKET
我希望文件的每一行都保存在自己的文件中，其名称是原始文件的行号（1、2、3等）。我还需要在每个序列之前添加一行，以 a 开头>，然后是行号。
所以，1.txt将是：
>1
VLLKHCGRMRRFLIRNLRSFLSHISLNTLKSQESKV
和2.txt：
>2
LLSSQAKMYFSLRENFYLEGGIETTFVPSGEVYSRSFLKGISRI
等等。我怎样才能做到这一点？
答案1
你可以使用awk：
awk '{print > NR".txt"}' file
NR是 中的当前行号awk，因此上面的命令会将每一行打印到一个文件中，该文件的名称是当前行号加上.txt.
如果您确实希望序列有>前缀，请使用以下命令：
awk '{print ">"$0 > NR".txt"}' file
>如果您想要正确的 FASTA 格式（每个序列前面都有以和序列名称开头的行），请使用以下命令：
awk '{printf ">%s\n%s\n",NR,$0 > NR".txt"}' file
这将产生如下文件：
$ cat 3.txt
>3
LNPNALPTSPISENWVMVRPIVAQISLRRMTPSAIGAQTEMA