qsub 从节点启动作业

qsub 从节点启动作业

我有一个使用命令启动的管道。由于某些管理/服务器原因,必须从节点启动该工具。该工具会触发管道中名为 pipeline.steps 的文件中的所有步骤。所以我要做的是

$ qsub -I
$ cd /path/to/my/tool/
$ ./launch-pipeline pipeline.steps

问题是,某些步骤需要在不同节点上并行化。文件内容pipeline.steps如下所示:

step1: 
  write_pbs_script ${NAME}.pbs
  qsub ${NAME}.pbs

setp2:
  continue...

由于我已经从节点启动管道,因此使用qsubwin 新创建的pbs脚本显然会失败。如何设法在节点中启动管道,并从该节点将新作业分派到不同的节点?

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