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如何在我的计算机上使用已编译 OpenBLAS 的存储库中的 Octave？

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如何在我的计算机上使用已编译 OpenBLAS 的存储库中的 Octave？

它一直建议使用 Octave 和我自己电脑中编译的 OpenBLAS（而不是从存储库中预编译的 OpenBLAS）将使计算速度更快。我使用 apt 从存储库安装了 GNU Octave (4.2.2)，并从https://www.openblas.net/。

如何让 Octave 使用这个 OpenBLAS？

到目前为止我已经尝试过什么。

编译 OpenBLAS 后，我将它安装在 中opt/openblas。

然后我输入命令

sudo update-alternatives --install /usr/lib/libblas.so libblas.so /opt/openblas/lib/libopenblas.so 50

sudo update-alternatives --install /usr/lib/libblas.so.3 libblas.so.3 /opt/openblas/lib/libopenblas.so 50

sudo update-alternatives --install /usr/lib/liblapack.so liblapack.so /opt/openblas/lib/libopenblas.so 50

sudo update-alternatives --install /usr/lib/liblapack.so.3 liblapack.so.3 /opt/openblas/lib/libopenblas.so 50

然后我配置使用新的 OpenBLAS

update-alternatives --config libblas.so 
update-alternatives --config libblas.so.3 
update-alternatives --config liblapack.so 
update-alternatives --config liblapack.so.3

最后我使用新的 OpenBLAS 运行 Octave，但出现了这个错误。

$ LD_PRELOAD=/opt/openblas/lib/libopenblas.so octave-cli
octave-cli: symbol lookup error: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libblas.so.3: undefined symbol: gotoblas

答案1

我建议从 Ubuntu 存储库中的所有内容开始。首先要尝试安装libopenblas-base包并允许它提供 BLAS 和 LAPACK 替代方案，就像这样简单：

sudo apt-get install octave
sudo apt-get install libopenblas-base

使用我们的测试脚本在我的 i7-3537u 上，Octave 的时序如下：

  • 0.42 秒 - 使用简单的默认值libblas3，liblapack3
  • 0.26 秒 -libopenblas-base来自存储库

如果您想要进一步优化它 - 可以通过以下方式在本地编译 OpenBLAS：

sudo apt-get build-dep libopenblas-dev

cd /tmp
apt-get source libopenblas-base
cd openblas-0.2.20+ds
DEB_CFLAGS_SET="-march=native -mtune=native" DEB_CFLAGS_SET="-march=native -mtune=native" dpkg-buildpackage  -uc -us -j8

sudo apt-get install ../libopenblas-base_0.2.20+ds-4_amd64.deb ../libopenblas-dev_0.2.20+ds-4_amd64.deb

这会将基准测试结果更改为：

  • 0.25 秒 -libopenblas-base自编译

因此，通过额外的手动优化来编译优化库是没有用的。

结论：我建议首先优化 Octave 代码，避免使用 for 循环，并尽可能使用矢量化函数。这将极大地提高性能。

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