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cut 命令似乎不适用于管道

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cut 命令似乎不适用于管道

我可以通过以下方式过滤掉在我们的排队系统中陷入困境的工作：

> qjobs | grep "racon" 
       5240703 racon-3/utg001564l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :03   
       5241418 racon-3/utg002276l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :02   
       5241902 racon-3/utg002759l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :03   
       5242060 racon-3/utg002919l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :04   
       5242273 racon-3/utg003133l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :03   
       5242412 racon-3/utg003270l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :04   
       5242466 racon-3/utg003325l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :03

但是，qjobs | grep "racon" | cut -d " " -f2没有返回例如racon-3/utg003325l-racon-3.fasta。我错过了什么？

答案1

每个空格都会计入字段编号，甚至是前导空格和连续空格。因此，您需要使用-f9而不是-f2.或者，您可以awk '{ print $2 }'完全代替 cut 命令。

答案2

如果输出的间距一致

qjobs | grep "racon" | cut -c 16-47

会产生类似的输出

racon-3/utg002276l-racon-3.fasta

如果您想要第一列，它看起来像 PID 或其他标识符，那么：

qjobs | grep "racon" | awk ' { print $1 } '

如果您正在寻找utg002276l 看起来像用户名的部分：

qjobs | grep "racon" | awk -F'[/-]' ' { print $3 } '

这使得 awk 使用斜杠和破折号字符作为字段分隔符，然后打印第三列。

答案3

您可以将所有空格压缩为一个：

qjobs | grep "racon" | tr -s ' ' | cut -d " " -f3

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