☰

无法在 R 上下载包（RStudio 和终端都无法）

tag-icon • tag-icon linux-mint r rstudio
无法在 R 上下载包（RStudio 和终端都无法）

我对 Linux 很陌生，我唯一的经验是使用以前属于别人的计算机，这意味着所有内容都已经配置/下载，我在上面完成我的工作没有问题，其中涉及使用一些 GIS 工具和 RStudio。

结果三天前我从老板那里收到了一台新电脑，我决定保持传统并安装Linux。我所有的同事都使用 Mint 18.3，所以我下载并安装了它。事实证明它并不像我想象的那么简单。

在阅读了此处发布的大量论坛和问题后，我设法更新了我的sources.list并插入了一个CRAN镜像以下载最新版本的R（3.4.4）。 RStudio 很快就认出了它。然而，安装新的软件包几乎是不可能的，即使是“本机”功能，例如导入数据集由于无法下载软件包而被禁用。

我尝试通过终端打开 R 并使用安装包功能，但问题依然存在。如何修复 RStudio 以便正确安装软件包？

下面是日志的副本（注意，我手动指定了镜像）：

> install.packages("Rcpp",repo="https://cloud.r-project.org/", type="source")
Installing package into ‘/home/iis/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4’
(as ‘lib’ is unspecified)
trying URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/Rcpp_0.12.16.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 3763400 bytes (3.6 MB)
==================================================
downloaded 3.6 MB

* installing *source* package ‘Rcpp’ ...
** package ‘Rcpp’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
g++  -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I../inst/include/     -fpic  -g -O2         -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time     -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c Date.cpp -o Date.o
/bin/bash: g++: command not found
/usr/lib/R/etc/Makeconf:168: recipe for target 'Date.o' failed
make: *** [Date.o] Error 127
ERROR: compilation failed for package ‘Rcpp’
* removing ‘/home/iis/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/Rcpp’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘Rcpp’ had non-zero exit status

再说一次，由于我对 Linux 很陌生，我真的不知道应该提供哪些信息来更好地帮助您，但请记住，一切都可能是默认/出厂设置。如果您需要更多信息，我可以为您提供（给出适当的说明）

答案1

在开始之前，许多 R 软件包依赖于以下开发工具，因此请先使用以下命令安装它们apt-get install：

r-base-dev

您可以通过 Rstudio 通过“工具”>“安装包”安装 R 包，它们也适用于 R。在以空格或列分隔的字段中输入包的名称。有时，您需要 Bioconductor 来安装软件包，您可以在此处找到该信息：

https://www.bioconductor.org/install/

给您一个概述：

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite()

这将设置包的包源 URL 以及下载和安装它们的脚本。

biocLite(c("GenomicFeatures", "AnnotationDbi"))

使用该语法并将包名称括在双引号中。然后它将继续下载和安装。

相关内容