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使用 Cygwin 在 Windows 上的 GROMACS 中打开 PDB 文件？

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使用 Cygwin 在 Windows 上的 GROMACS 中打开 PDB 文件？

我是第一次使用 GROMACS。根据这个优秀的教程 (http://www.mdtutorials.com/gmx/lysozyme/01_pdb2gmx.html），我下载了lyzozyme的PDB文件，然后去除水分子，在CygwinShell（激活GROMACS）上输入以下命令。

$ gmx pdb2gmx -f 1AKI_clean.pdb -o 1AKI_processed.gro -water spce

但是，我收到一条错误消息：

在命令行选项 -f 中，文件 1AKI_clean.pdb 不存在或无法访问。

请指教我哪里做错了。任何见解都将不胜感激。谢谢，Neena

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