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grep -v 问题获取超过一千个文件的行数（单个行数）

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grep -v 问题获取超过一千个文件的行数（单个行数）

我需要在 VCF 文件上使用此命令：

grep -v "#" {name of VCF file} | wc -l

这给了我没有“#”的行数。

但我的问题是，我的目录中有很多文件，我需要单独的行计数。所以我需要每个文件中不带“#”的行数。

当我这样做时：grep -v "#" *.vcf* | wc -l，管道只是总结所有文件的行，不带 #。我需要分别了解每个文件的行数。我无法手动通过管道传输每个文件的行（我有一千多个文件）。任何人都可以建议我如何获取每个文件的行数。先感谢您！

答案1

只需使用grep -c而不是管道wc -l：

grep -c -v -- '#' *.vcf

请注意，如果当前目录中只有一个 vcf 文件，则不会输出其名称，您只会得到计数。

grep要解决这个问题，您可以通过 GNU 实现或兼容来添加该-H选项。

grep -Hcv -- '#' *.vcf

对于其他实现，您可以随时将其添加/dev/null到列表中并通过管道tail -n +2将其删除：

grep -c -v -- '#' /dev/null *.vcf | tail -n +2

（尽管除非您设置支持的 shell 选项，否则您将grep在此过程中丢失退出状态）。pipefail

另一方面，如果您只需要不带文件名的每个计数，请使用-h而不是-HGNU ，或者使用不支持的实现的grep循环：grep-h

for file in *.vcf; do grep -cv '#' < "$file"; done

或者报告整体退出状态的失败：

(
  ret=0
  for file in *.vcf; do
    grep -cv '#' < "$file" || ret=$?
  done
  exit "$ret"
)

如果你得到一个参数列表太长grep错误，您可以借助以下工具将列表拆分为多个调用xargs（此处假设为 GNU 工具）：

printf '%s\0' *.vcf | xargs -r0 grep -cvH -- '#'

或者如果zsh与它一起使用zargs：

autoload zargs
zargs -r -- *.vcf(Nn.) -- grep -cvH -- '#'

（这里还使用其 glob 限定符功能来限制为常规文件 ( .)，对文件列表使用数字排序顺序 ( n) 并避免在没有 vcf 文件 ( -rwith N) 时出现错误）。

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