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如何在 R(xtable) 中使用 Latex 生成的表格？

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如何在 R(xtable) 中使用 Latex 生成的表格？

我有一个由 Excel 生成的 LaTeX 表格。我想将此表格放置为 xtable，而不是 LaTeX 代码。可以将 LaTeX 转换为 xtable 吗？

答案1

分步设置：假设您有一个file.xlsx如下内容：

Excel 文件

要转换为 R，首先导出到file.csv：

,apples,tomatoes,babanas
Jinks,3,12,15
Pixie,4,5,6
Dixie,2,8,9

mytable然后在 R 中 导入为数据框：

> mytable <- read.table("file.csv", header=TRUE, sep=",") 
> mytable

      X apples tomatoes babanas
1 Jinks      3       12      15
2 Pixie      4        5       6
3 Dixie      2        8       9

或者直接从导入file.xlsx（需要在你的系统上安装 Perl）：

> library(gdata) 
> mytable  <- read.xls("file.xlsx")

无论如何，获得的数据框必须相同。万一第一列实际上是如上所示的行名：

> rownames(mytable) <- mytable[,1]
> mytable[,1] <- NULL
> mytable

      apples tomatoes babanas
Jinks      3       12      15
Pixie      4        5       6
Dixie      2        8       9

将数据框转换mytable为 xtable（即一块 LaTeX 代码）：

> library(xtable) 
> xtable(mytable)

% latex table generated in R 3.1.1 by xtable 1.7-4 package
% Wed Mar 11 06:11:44 2015
\begin{table}[ht]
\centering
\begin{tabular}{rrrr}
  \hline
 & apples & tomatoes & babanas \\ 
  \hline
Jinks &   3 &  12 &  15 \\ 
  Pixie &   4 &   5 &   6 \\ 
  Dixie &   2 &   8 &   9 \\ 
   \hline
\end{tabular}
\end{table}

因此，您可以将 R 的输出复制并粘贴到 LaTeX 文件中以获得：

微波辐射计

但是 LaTeX+R 的优点是，你可以自动将上述所有操作插入到file.tex文档中（现在是 R noweb 文档，因此将其另存为file.Rnw），然后使用Sweave或knitr从命令行对其进行编译（请参阅 如何从命令行构建 Knitr 文档）或者简单地在 Rstudio 中制作：

File> New file> R Sweave> 写一些类似的：

\documentclass[twocolumn]{article}
\usepackage{titlecaps}
\usepackage{lipsum}
\title{Owners {\it \&} Fruits}
\author{Fran}
\begin{document}
\maketitle
<<mytable,echo=FALSE,warning=FALSE,message=FALSE,results='hide'>>=
library(gdata) 
mytable  <- read.xls("file.xlsx")
rownames(mytable) <- mytable[,1]
mytable[,1] <- NULL
library(xtable) 
@
\section*{Introduction}
The cartoons (\Sexpr{row.names(mytable)}) are shooting fruits (\Sexpr{names(mytable)}). 
\lipsum[2] 
\section*{Cartoons have \Sexpr{sum(mytable$apples)} apples}
\lipsum[3]
<<xtable,echo=FALSE,warning=FALSE,message=FALSE,results='asis'>>=
print(xtable(mytable, caption="My Excel table"), caption.placement = "top")
@
\lipsum[4-15]
\end{document}

最后，点击Compile PDF，你将获得file.pdf：

平均能量损失

答案2

更一般地，如果你有一个乳胶表，my_file.tex例如：

% latex table generated in R 3.1.1 by xtable 1.7-4 package
% Wed Mar 11 06:11:44 2015
\begin{table}[ht]
\centering
\begin{tabular}{rrrr}
  \hline
 & apples & tomatoes & bananas \\ 
  \hline
Jinks & 3 & 1 & 15 \\ 
  Pixie & 4 & 5 & 6  \\ 
  Dixie & 2 & 8 & 9  \\ 
  \hline
\end{tabular}
\end{table}

您可以直接将其导入R中，例如：

library("data.table") # loads the smart "fast" fread function

#import data into R
data <- fread("my_file.tex", skip=8, sep="&", data.table=F) # skips in compatible lines
names <- read.table("my_file.tex", skip=6, nrow=1, sep="&", stringsAsFactors=F)

#remove latex symbols from header
names<-gsub("\\\\", "", as.character(names))
names<-gsub(" ", "", as.character(names))
colnames(data) <- names

remove latex end of line from last column
data[,ncol(data)]<-gsub("\\\\", "", as.character(data[,ncol(data)]))
data[,ncol(data)]<-gsub(" ", "", as.character(data[,ncol(data)]))
data[,ncol(data)] <- as.numeric(data[,ncol(data)]) #change type as desired

data调用R后将返回以下内容：

     NA apples tomatoes bananas
1 Jinks      3        1      15
2 Pixie      4        5      6
3 Dixie      2        8      9

笔记：需要 data.table 1.10.0 或更高版本

您还可以将其从 R 导出到 LaTeX：

library("xtable")    
#function to export (filename defaults to object in R environment)
export_latex <- function(x, file) print(xtable(data.frame(x), type="latex", file=paste0(deparse(substitute(x)), ".tex"))
export_latex(data, file="my_file.tex")

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