我似乎无处可寻能够找到如何就地解决这种情况。
发生了什么：
前，
C：~= 90GB，新安装的 Win 8.1 Enterprise，64 位
D: ~= 880GB，也是 ntfs。主要用于数据文件。仍然包含非工作 Win8.0 的文件夹，当时它以前是 C: 驱动器。
chkdsk在高级工具、命令提示符启动选项中，C 和 D 的手册运行良好。没有错误。
接下来，使用 Minitool Partition Magic 将相邻的 D: 合并到 C:，作为子目录光盘
确保顺序正确，即 C:\Windows 前后相同，并且原本直接位于 C:\ 下的其他文件仍在那里，而不是在光盘现在。
后：
Win8.1 可以加载，但已安装程序（到 C:）的大多数图标都是空白的。explorer.exe
的视图中完全没有“C:\Program Files”和“C:\Program Files (x86)”以及其他文件夹，并且 cmd.exe 以管理员身份运行。但是，可用磁盘空间与已用磁盘空间加起来大约等于合并前 C: 和 D: 的容量。
这使我相信分配的文件和文件夹仍然写在磁盘上。
我的假设是，不知何故，ntfs 权限/所有权/ACL 被搞乱了，可能将不再存在的旧 D：MFT 映射强加到那些消失的文件夹上。
也许当前的 SYSTEM/Administrator/TrustedInstaller/User/...? 帐户突然无法看到以某种方式链接到丢失文件夹的任何 ID？如果是这样，如何恢复？如何获得 C: 驱动器的类似 root 的视图，而不考虑所有权或 ACL？
所有研究似乎都指向使用工具来取消删除文件或抓取未分配的空间；但似乎没有什么可以解决混乱的安全描述符问题。
chkdsk /f c:事后手动运行，未检测到任何错误。sfc /scannow
笔记
- 旧的 C：分区位于 EFI 分区之后，比旧的 D 分区更早。
- 安装了 R-Studio 等恢复/取证工具，现在都无法访问，因为它们位于旧的“C:\Program Files”或“C:\Program Files (x86)”下
- 在合并后的 Windows 8.1 中，针对 C: 运行用户级程序（如 WinDirStat）没有显示文件占用的足够空间，无法与从
dir命令 shell 运行列出的“可用空间”保持一致。更有理由让我怀疑，从 ntfs 的角度来看，fs 结构很好，文件夹并没有真正消失。只是 Windows 8.1 中的“SYSTEM”帐户也看不到它们。但是，我可能错了。还有其他想法吗？
答案1
对于遇到这些可能罕见情况的人：
我的怀疑是正确的，丢失的文件夹仍然在磁盘上，尽管看不见。
在隐藏的c:\found.000
（我怀疑这是由于分区软件的批处理作业运行后，自动chkdsk重新启动 Windows 造成的。）
我应该知道要检查...希望在我让 Windows 进行不完美的自我修复之前就知道sfc，这会创建上述所有三个文件的准系统副本，并让我后来进行大量仔细的文件合并和手动链接解析。
许多其他文件（来自较旧的 D: 分区，现已合并到 C:）列出的所有者类似于
帐户未知(S-1-5-21-580982140-4090956935-1935414389-1001)
这并不奇怪。
类似命令
icacls * /grant:r everyone:f /t
和
takeown /F .
帮助重新获得这些访问权限。