在 Ubuntu 18.04 上安装/更新 R 3.6

在 Ubuntu 18.04 上安装/更新 R 3.6

我最近购买了一台装有 Ubuntu 18.04 的机器。我简单地安装了 R:

sudo apt-get install r-base

当我调用$ R控制台时,它会启动:

R version 3.4.4 (2018-03-15) -- "Someone to Lean On"
Copyright (C) 2018 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
...

我想安装 R 3.6,主要是因为我需要BiocManager通过以下方式获得其他 R 软件包的一堆最新版本BiocManager.我已按照步骤操作这里,所以现在我的/etc/apt/sources.list/样子(只是相关的底部部分):

deb http://security.ubuntu.com/ubuntu bionic-security main restricted
# deb-src http://security.ubuntu.com/ubuntu bionic-security main restricted
deb http://security.ubuntu.com/ubuntu bionic-security universe
# deb-src http://security.ubuntu.com/ubuntu bionic-security universe
deb http://security.ubuntu.com/ubuntu bionic-security multiverse
# deb-src http://security.ubuntu.com/ubuntu bionic-security multiverse
deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/
# deb-src https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/

deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu trusty-cran35/
# deb-src https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/

然后又跑了sudo apt-get install r-base

但是当我$ R再次从控制台运行时,我仍然看到:

R version 3.4.4 (2018-03-15) -- "Someone to Lean On"
Copyright (C) 2018 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
...

我有什么遗漏的吗?一般来说,我对设置 R 和 Linux 很陌生,所以我感觉我缺少大量关于可通过apt-get、Ubuntu 的 R 版本控制等提供的内容的文献。任何有用手册页的链接也会非常有帮助。

编辑: 继评论后:

然:

sudo apt update
sudo apt-get install r-base

没有新的效果;来自控制台的callnigR仍然会显示 R v3.4.4。

apt-cache policy r-base显示:

r-base:
  Installed: 3.4.4-1ubuntu1
  Candidate: 3.4.4-1ubuntu1
  Version table:
 *** 3.4.4-1ubuntu1 500
        500 http://au.archive.ubuntu.com/ubuntu bionic/universe amd64 Packages
        500 http://au.archive.ubuntu.com/ubuntu bionic/universe i386 Packages
        100 /var/lib/dpkg/status

我认为这意味着 R v3.6 根本没有安装?

答案1

根据https://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/README.html 你应该添加(考虑到你正在使用 18.04,bionic)

deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/

给你的

/etc/apt/sources.list

在那之后

sudo apt update

sudo apt install r-base

答案2

不幸的是,我无法评论 AndreyIto 的答案。

对我来说它必须xenial-cran35disco-cran35

所以:

sudo add-apt-repository 'deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial-cran35/'
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
sudo apt update
sudo apt install r-base

有关详细信息和其他 Ubuntu 版本,请参阅cran.r-project.org:

答案3

我在 Ubuntu 18.04.3 上成功安装了 R 3.6.1,如下所示:

sudo add-apt-repository 'deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu disco-cran35/'
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
sudo apt update
sudo apt install r-base

答案4

尝试

echo deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ | sudo tee /etc/apt/sources.list

sudo apt update

sudo apt install r-base

R --version

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